More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1330 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1330  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  48.83 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  44.02 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0274  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  44.02 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1394  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_106  DNA-binding response regulator  43.27 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_86  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0316  DNA-binding response regulator  42.23 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  45.19 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0124  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1355  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0300  DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1311  DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  36.95 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  37.13 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  36.55 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  33.84 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  35.12 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  37.5 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.76 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  37.31 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  38.14 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  36.95 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  32.83 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  32.83 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.86 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  32.83 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  35.9 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.83 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  32.83 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  32.83 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  32.83 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  35.42 
 
 		 232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.87 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.98 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 232 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 235 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  35.35 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  37.63 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 228 aa  130  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.49 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  35.47 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  35.47 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  35.47 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.54 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  37.76 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36.5 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2490  DNA-binding response regulator KdeP  34.83 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  31.86 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0057  two component transcriptional regulator  34.83 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0059  response regulator receiver  34.83 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.24 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  35.35 
 
 		 234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  36.5 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>