More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1155 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  87.56 
 
 		 229 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.95 
 
 		 226 aa  350  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  76.56 
 
 		 226 aa  344  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.03 
 
 		 229 aa  343  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.64 
 
 		 225 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  75 
 
 		 225 aa  334  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  75 
 
 		 225 aa  334  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 225 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  75 
 
 		 225 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.52 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.52 
 
 		 225 aa  332  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.52 
 
 		 225 aa  331  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.16 
 
 		 225 aa  331  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.16 
 
 		 225 aa  331  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  73.68 
 
 		 225 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  73.68 
 
 		 225 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  73.21 
 
 		 225 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  73.08 
 
 		 225 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  72.6 
 
 		 225 aa  321  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  63.94 
 
 		 231 aa  288  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  66.51 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  66.51 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  68.9 
 
 		 234 aa  286  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  63.72 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  63.46 
 
 		 231 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  65.42 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  64.11 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  64.11 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  64.11 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  62.5 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  62.68 
 
 		 232 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.51 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  63.64 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  63.64 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  63.64 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  62.68 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.2 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 232 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.24 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  62.2 
 
 		 230 aa  270  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  63.33 
 
 		 230 aa  267  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  59.81 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  57.41 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  59.42 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3117  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.12 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  56.46 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.11 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.88 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.14 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  51.44 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  50 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.66 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  54.9 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.44 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  55.29 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  51.44 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  52.15 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  50.72 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  50.96 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  50.96 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  50.48 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  50.24 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  51.69 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  51.44 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.95 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  49.28 
 
 		 230 aa  216  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  49.04 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0348  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.96 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  49.52 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.47 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.24 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  51.21 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  48.8 
 
 		 230 aa  205  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.51 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  49.76 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.89 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1436  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.15 
 
 		 374 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.196067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  49.04 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  48.31 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>