More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4842 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4842  alanine racemase  100 
 
 		 394 aa  809    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00589752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2407  alanine racemase  41.87 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2416  alanine racemase  36.66 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000187252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  34.84 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  35.77 
 
 		 370 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.77 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.17 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  30.59 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.64 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  34.84 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  31.88 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.03 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.81 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  32.13 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  34.24 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.9 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.04 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.58 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.73 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.52 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  31.46 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.43 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  31.25 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  29.94 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  29.94 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  29.58 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  31.3 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  35.36 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  31.97 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.13 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  31.18 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.95 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  33.33 
 
 		 851 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  33.33 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.67 
 
 		 403 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.67 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  30.2 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  33.78 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.49 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.05 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  31.4 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  30.85 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.62 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  29.66 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  37.1 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  33.52 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  30.68 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  28.3 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  28.02 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  30.34 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  28.37 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  28.02 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  28.02 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  28.33 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  32.67 
 
 		 811 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  27.75 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  27.75 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0325  alanine racemase  35.79 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  34.17 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  31.37 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  31.91 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  27.75 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  31.56 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  31.4 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  30.1 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  32.4 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  29.83 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  29.13 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  30.25 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  30.97 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  30.2 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  30.68 
 
 		 421 aa  156  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  30.97 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  30.31 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  30.68 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  27.25 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  30.68 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  30.68 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  27.25 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  28.41 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  30.68 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  30.47 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  30.92 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  36.88 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  30.4 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  32.64 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  27.84 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  29.83 
 
 		 842 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  29.83 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  30.4 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  28.61 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  30.4 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  31.15 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  33.05 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  30.42 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  31.56 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  31.49 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  31.01 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  35.91 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  32.49 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>