More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2416 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2416  alanine racemase  100 
 
 		 399 aa  817    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000187252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4842  alanine racemase  36.66 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00589752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2407  alanine racemase  34.44 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  33.33 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.24 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.78 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.5 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.42 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  31.62 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.22 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  32.39 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.64 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  30.88 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  31.53 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  30.85 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  30.06 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.68 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  30.81 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.92 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  30.77 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  30.59 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  29.86 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  30.4 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  34.35 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  32.53 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  30.19 
 
 		 390 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  29.61 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  29.33 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  29.05 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  29.86 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  29.3 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  29.33 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  29.33 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  30.56 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.45 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  28.49 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  29.33 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  28.77 
 
 		 391 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  29.05 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  29.05 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  33.9 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  30.95 
 
 		 395 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  30 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  30 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.04 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  28.43 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  29.81 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  30 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  29.28 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  28.99 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  30 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  28.99 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  29.97 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  28.98 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  30.32 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  30.57 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  29.46 
 
 		 851 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  28.69 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  29.05 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  28.69 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  31.56 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  28.45 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  28.24 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  30.8 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  29.68 
 
 		 834 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  32.28 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  32.28 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  28.24 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  32.06 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  29.3 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  26.67 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  29.1 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  29.13 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  36.4 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  29.92 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  31.82 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  30.92 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  29.76 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  27.92 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  28.2 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  32.99 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  29.14 
 
 		 369 aa  147  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  29.46 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  30.7 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  33 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  31.49 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  29.86 
 
 		 849 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  29.33 
 
 		 811 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  30.74 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  26.09 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  28.98 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  32.11 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  28.05 
 
 		 410 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  30.14 
 
 		 844 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>