282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4088 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4088  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 498 aa  1017    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.95 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  26.79 
 
 		 473 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.92 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  27.1 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.92 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.45 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  28.6 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.01 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  27.01 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.62 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  28.2 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.63 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 476 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.55 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.72 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  27.44 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.31 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.77 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  27.89 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  25.71 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  25.79 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.1 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 		 479 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  26.77 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  24.9 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  26.32 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  26.05 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.49 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.17 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  26.77 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.85 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.31 
 
 		 460 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.58 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  27.06 
 
 		 481 aa  93.6  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  28.11 
 
 		 481 aa  93.2  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 		 481 aa  93.2  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  25.81 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  34.12 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  27.88 
 
 		 471 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.82 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  26.65 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  26.09 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 496 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  26.71 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.26 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.04 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  25.06 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  25.06 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  25.06 
 
 		 481 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  25.94 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.8 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  25.94 
 
 		 497 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 486 aa  90.1  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  24.84 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.99 
 
 		 471 aa  90.1  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 		 475 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 		 475 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  25.15 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  26.14 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  27.33 
 
 		 480 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  25.68 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  26.16 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  29.46 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  30.16 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  25 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  25.93 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  30.16 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  25.73 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  28.24 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  31.4 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  26.15 
 
 		 481 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  25.24 
 
 		 481 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>