More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3089 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3089  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  100 
 
 
425 aa  873    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000498843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  71.67 
 
 
417 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.45 
 
 
387 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.48 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  35.48 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.58 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.71 
 
 
378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.58 
 
 
388 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  35.6 
 
 
383 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.88 
 
 
378 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.7 
 
 
388 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.28 
 
 
388 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.28 
 
 
388 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.28 
 
 
388 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.39 
 
 
384 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.56 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
389 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.46 
 
 
385 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4214  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  33.42 
 
 
403 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3757  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.01 
 
 
388 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.32 
 
 
386 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.3 
 
 
379 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.29 
 
 
382 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.18 
 
 
388 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.32 
 
 
386 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.68 
 
 
388 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.76 
 
 
381 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.1 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.59 
 
 
387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.54 
 
 
409 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.49 
 
 
385 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.2 
 
 
392 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2181  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.58 
 
 
388 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.28 
 
 
388 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.2 
 
 
390 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.08 
 
 
389 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.05 
 
 
387 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.17 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2341  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.28 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
392 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2812  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.13 
 
 
388 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.32 
 
 
382 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.77 
 
 
388 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.08 
 
 
391 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.9 
 
 
386 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.96 
 
 
368 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.52 
 
 
384 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.13 
 
 
388 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0504146  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.03 
 
 
389 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.36 
 
 
388 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.99 
 
 
385 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.23 
 
 
388 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01357  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.83 
 
 
388 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1839  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1790  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.83 
 
 
388 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.1 
 
 
388 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
391 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.61 
 
 
388 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.61 
 
 
388 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
388 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.2 
 
 
392 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
388 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
388 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004110  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] beta chain  36.53 
 
 
388 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
381 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.06 
 
 
390 aa  176  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.53 
 
 
388 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00288074  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1838  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.062455  normal  0.042007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2626  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00132784  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.54 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.66 
 
 
383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.1 
 
 
388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.63 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.69 
 
 
388 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.94 
 
 
384 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  33.91 
 
 
399 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  34.73 
 
 
390 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.69 
 
 
388 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  35.33 
 
 
386 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.84 
 
 
382 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.34 
 
 
398 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  31 
 
 
388 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0848  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.03 
 
 
388 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  30.73 
 
 
392 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  31.41 
 
 
390 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  31.41 
 
 
390 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  31.41 
 
 
392 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.23 
 
 
394 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.73 
 
 
388 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.03 
 
 
382 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.73 
 
 
388 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.17 
 
 
388 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>