222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2588 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
210 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  72.04 
 
 
212 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  72.38 
 
 
211 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  71.43 
 
 
211 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  62.86 
 
 
206 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  62.38 
 
 
206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  55.92 
 
 
207 aa  244  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  48.82 
 
 
206 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  50.72 
 
 
208 aa  214  9e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  53.05 
 
 
204 aa  211  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  46.48 
 
 
211 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
211 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.89 
 
 
211 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  47.42 
 
 
211 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  45.07 
 
 
208 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
211 aa  191  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  43.19 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
191 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  43.62 
 
 
191 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 
188 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  41.05 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
193 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  40.96 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 
198 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
191 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  39.67 
 
 
189 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
190 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
204 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
199 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
190 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
193 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  35.71 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  38.83 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 
204 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  38.1 
 
 
194 aa  121  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
189 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  35.64 
 
 
207 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
205 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
193 aa  92  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  26.23 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  25.4 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  27.6 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  25.4 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  27.14 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  23.83 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  26.13 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  25.65 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  26.12 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.66 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  25.58 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 
262 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>