More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2920 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2920  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3225  hypothetical protein  56.83 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3423  extracellular solute-binding protein family 1  56.83 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  43.63 
 
 		 344 aa  275  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0580  LacI family transcription regulator  42.04 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1261  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  33.44 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  31.95 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  32 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  33.22 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.17 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.15 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.39 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.39 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  30.39 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  30.39 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.39 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.39 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.21 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.9 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  30.53 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  30.53 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  30.53 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  30.53 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.22 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  30.22 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  26.75 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  26.97 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  31.17 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  30.22 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  30.22 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  28.22 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  28.76 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.1 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  27.59 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  26.97 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  27.59 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  31.03 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  26.16 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.97 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.25 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.25 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.25 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  30.46 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.25 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.25 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  26.64 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.72 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  25.3 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.31 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  28.26 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.02 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  26.32 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  24 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.59 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  24.92 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  28.66 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.35 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.35 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  28.35 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>