67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5703 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 856 aa  1782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  31.16 
 
 		 840 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  31.9 
 
 		 898 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1028 aa  252  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  27.17 
 
 		 673 aa  248  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1042 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  31.52 
 
 		 672 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  29.7 
 
 		 672 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  30.26 
 
 		 684 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  25.61 
 
 		 658 aa  174  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 1225 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  25.72 
 
 		 704 aa  90.1  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1096 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  31.08 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  23.84 
 
 		 1257 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  24.05 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  27.48 
 
 		 1431 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.13 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1433 aa  77.8  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  20.15 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  26.64 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  21.81 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  20.35 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  21.7 
 
 		 637 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  21.7 
 
 		 637 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  20 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.82 
 
 		 1256 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  27.07 
 
 		 1256 aa  72  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.82 
 
 		 1256 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  22.93 
 
 		 673 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1433 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  29.79 
 
 		 633 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  38.61 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  36.36 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1253 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  41.03 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  30.46 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  24.15 
 
 		 633 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  33.67 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  26.19 
 
 		 633 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  43.1 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  29.8 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  24.77 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  24.44 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  23.71 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  26.4 
 
 		 642 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 647 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1338 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  28.57 
 
 		 647 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  23.31 
 
 		 621 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  25.97 
 
 		 636 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  23.31 
 
 		 621 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  23.93 
 
 		 632 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  30.56 
 
 		 659 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  24 
 
 		 637 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  38.33 
 
 		 624 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  38.33 
 
 		 624 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  43.1 
 
 		 665 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  21.03 
 
 		 613 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  21.03 
 
 		 613 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  41.38 
 
 		 626 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  41.38 
 
 		 626 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  41.38 
 
 		 634 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  41.38 
 
 		 626 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  41.38 
 
 		 629 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  41.38 
 
 		 588 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  41.38 
 
 		 632 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>