41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5169 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5169  DNA primase  100 
 
 		 311 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.55186  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0912  DNA primase  38.08 
 
 		 298 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  33.11 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7006  hypothetical protein  32.8 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.68287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1970  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0951482  normal  0.0521635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6337  hypothetical protein  29.04 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  31.62 
 
 		 583 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  31.62 
 
 		 583 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  47.73 
 
 		 618 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  43.4 
 
 		 626 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  30.71 
 
 		 588 aa  47  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  40 
 
 		 646 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  40 
 
 		 646 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  28.68 
 
 		 553 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  28.68 
 
 		 572 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  54.29 
 
 		 656 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  39.22 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  48.72 
 
 		 619 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  41.51 
 
 		 623 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  48.78 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  45 
 
 		 600 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  27.5 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  24.44 
 
 		 591 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  27.5 
 
 		 663 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  51.28 
 
 		 629 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  41.51 
 
 		 579 aa  44.3  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  47.5 
 
 		 605 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  40.68 
 
 		 564 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  57.58 
 
 		 632 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  57.58 
 
 		 627 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  42.31 
 
 		 629 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  43.14 
 
 		 645 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  33 
 
 		 647 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  51.28 
 
 		 680 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.6 
 
 		 599 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  45 
 
 		 675 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  26.83 
 
 		 666 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  46.34 
 
 		 634 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  46.34 
 
 		 633 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  56.25 
 
 		 718 aa  42.4  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  42 
 
 		 634 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>