More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5079 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  100 
 
 		 459 aa  959    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  26.11 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  28.35 
 
 		 492 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  24.94 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.27 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.55 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  23.84 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.88 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.39 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  25.58 
 
 		 516 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  26.73 
 
 		 445 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.35 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.04 
 
 		 496 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.22 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26.19 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  23.34 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  23.34 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  25.87 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.05 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.05 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.05 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.6 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.54 
 
 		 616 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.16 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.42 
 
 		 478 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 		 478 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.99 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.05 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  23.28 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.57 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.07 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  22.98 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.22 
 
 		 624 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  21.9 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.47 
 
 		 565 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.44 
 
 		 496 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.04 
 
 		 625 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.32 
 
 		 619 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  26.55 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.53 
 
 		 592 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  24.62 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.54 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.16 
 
 		 619 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  26.06 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  23.76 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  23.58 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.67 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.11 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 		 478 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.23 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.95 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.19 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.64 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.64 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25 
 
 		 495 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.11 
 
 		 628 aa  93.6  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  23.42 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.53 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  22.65 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  23.09 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.35 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  24.01 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.09 
 
 		 495 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  25.39 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  25 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  23.16 
 
 		 462 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  24.25 
 
 		 465 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.39 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.39 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.79 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  25.11 
 
 		 469 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  22.56 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  23.73 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  22.56 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  22.56 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  21.78 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  24.34 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  23.25 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  24.27 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.27 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  22 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  23.58 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  25.82 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  21.72 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  24.48 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  21.44 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  23.08 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  21.32 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  21.9 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  23.16 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.79 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  23.55 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.98 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>