142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4334 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  55.62 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  43.75 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  58.94 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  46.86 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  53.55 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  42.5 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  42.94 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  42.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  42.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  39.08 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  37.77 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  32.34 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  40.24 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  36.7 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  42.94 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  35.38 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  46.81 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  39.77 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  34.9 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  40.38 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  37.17 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  37.17 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  44.06 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  40.38 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  34.58 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  37.16 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  39.86 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  33.15 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  36.18 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  39.89 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  39.63 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  36.32 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  35.03 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  38.69 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  37.65 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0291  hypothetical protein  37.72 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  34.04 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  41.09 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  39.64 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  34.78 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  37.33 
 
 		 315 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  39.29 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  33.73 
 
 		 435 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  33.52 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  33.17 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  40.43 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  44.63 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  39.71 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  39.1 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  35.62 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  35.03 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  31.77 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  31.94 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  33.15 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  38.12 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  33.15 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  37.42 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  31.61 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  38.3 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  33.53 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  39.1 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  33.54 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  38.24 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  38.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  32.96 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  31.68 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  31.19 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  40.15 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  33.71 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  31.72 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  29.22 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  30.81 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  37.88 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  31.21 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  38.58 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  36.05 
 
 		 305 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  39.17 
 
 		 396 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  32.32 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  29.78 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  38.35 
 
 		 386 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  37.42 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  36.77 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  37.59 
 
 		 389 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  37.59 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  29.32 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  33.91 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  34.01 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  41.18 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  33.13 
 
 		 286 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  35.81 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  36.62 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  37.01 
 
 		 419 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  36.89 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  35.62 
 
 		 314 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  31.44 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>