More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1877 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
310 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 
294 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4568  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
311 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.364074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  22.8 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  23.13 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  23.59 
 
 
301 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
291 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  22.92 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  35.96 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  26.07 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  32.74 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  35.04 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  24.76 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  28.95 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  28.95 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  25.77 
 
 
329 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.83 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  30.14 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  36.28 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  33.62 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  24.1 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  29.86 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  34.75 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  34.75 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  30 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  33.61 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  30.83 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  33.9 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  30.65 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  34.75 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.43 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  21.71 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  34 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  28.24 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  26.32 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  31.3 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  23.21 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  25.74 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  29.69 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  27.91 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  29.45 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  27.82 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  25.61 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  31.03 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  30.83 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  35.4 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  25.61 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  27.91 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
280 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  31.9 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  30.71 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  35 
 
 
339 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  29.84 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  27.42 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  27.15 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  28.36 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  26.23 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  28.46 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2006  proline iminopeptidase  30.83 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.749517  hitchhiker  0.00407135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>