More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3629 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  607  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  32.69 
 
 
328 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  34.34 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  35.41 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  36.11 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  34.75 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  34.51 
 
 
317 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  34.51 
 
 
317 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  33.66 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  33.66 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  33 
 
 
310 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
310 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  33.68 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  32.17 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  32.65 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  48.15 
 
 
320 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  33.11 
 
 
320 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  33.92 
 
 
321 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  32.79 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  31.8 
 
 
316 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  33.55 
 
 
320 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  28.29 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  32.11 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  32.13 
 
 
311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  46.15 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  31.27 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  29.51 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  44.27 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  44.27 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  44.27 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  31.79 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
312 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
436 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  46.46 
 
 
312 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  33.01 
 
 
318 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  31.79 
 
 
414 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  28.38 
 
 
316 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  29.41 
 
 
316 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  31.29 
 
 
323 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  31.15 
 
 
323 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  34.73 
 
 
318 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  31.42 
 
 
315 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  32.98 
 
 
323 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  32.98 
 
 
323 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  31.45 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  33.22 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  32.06 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  42.75 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  32.11 
 
 
323 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  31.61 
 
 
319 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  30.22 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  31 
 
 
323 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  44.27 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  30.74 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  32.67 
 
 
329 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  32.68 
 
 
326 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  29.47 
 
 
323 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  33.22 
 
 
323 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  47.15 
 
 
339 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  27.51 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  30.5 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  32.89 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  31.03 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  30.93 
 
 
318 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  37.4 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  34.65 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  28.57 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  28.81 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  30.5 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  30.59 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  33.76 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  46.55 
 
 
319 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  45.19 
 
 
321 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  30.96 
 
 
312 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  43.09 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  29.66 
 
 
319 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  31.13 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  32.76 
 
 
316 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  34.76 
 
 
337 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  45.97 
 
 
361 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  29.55 
 
 
321 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  32.56 
 
 
316 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  30.9 
 
 
313 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  29.61 
 
 
316 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  30.87 
 
 
316 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  35.5 
 
 
345 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  30.46 
 
 
316 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.95 
 
 
298 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  30.56 
 
 
313 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  30.49 
 
 
342 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  29.63 
 
 
329 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  42.5 
 
 
329 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
326 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>