More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0838 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  65.83 
 
 		 838 aa  1141    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  68.61 
 
 		 861 aa  1167    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  63.92 
 
 		 894 aa  1101    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  66.19 
 
 		 838 aa  1146    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  64.41 
 
 		 897 aa  1142    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  57.03 
 
 		 863 aa  937    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  56.55 
 
 		 776 aa  874    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  63.12 
 
 		 877 aa  1125    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  60.98 
 
 		 898 aa  1050    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  55.8 
 
 		 880 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  62.44 
 
 		 880 aa  1032    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  56.25 
 
 		 834 aa  957    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  65.3 
 
 		 950 aa  1151    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  60.37 
 
 		 899 aa  1039    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  48.01 
 
 		 875 aa  701    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  69.02 
 
 		 832 aa  1139    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  71.69 
 
 		 843 aa  1244    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  59.43 
 
 		 843 aa  984    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  58.1 
 
 		 848 aa  962    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  65.45 
 
 		 899 aa  1150    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  60.86 
 
 		 898 aa  1046    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  65.82 
 
 		 853 aa  1111    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  63.71 
 
 		 885 aa  1110    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  69.26 
 
 		 850 aa  1196    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  65.7 
 
 		 838 aa  1111    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  57.98 
 
 		 848 aa  962    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  64.73 
 
 		 822 aa  1094    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  58.03 
 
 		 833 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 844 aa  1739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.37 
 
 		 860 aa  998    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  65.26 
 
 		 838 aa  1120    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  57.98 
 
 		 848 aa  962    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  57.45 
 
 		 851 aa  918    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  60.69 
 
 		 944 aa  1035    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  62.21 
 
 		 881 aa  1060    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  53.74 
 
 		 845 aa  856    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  53.8 
 
 		 827 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  44.92 
 
 		 968 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  46.19 
 
 		 945 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  44.18 
 
 		 939 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  43.89 
 
 		 939 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  44.55 
 
 		 961 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  45.26 
 
 		 946 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  45.3 
 
 		 960 aa  585  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  45.2 
 
 		 963 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  46.91 
 
 		 973 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  46.49 
 
 		 973 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  46.49 
 
 		 973 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  46.11 
 
 		 946 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  45.65 
 
 		 952 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  44.02 
 
 		 952 aa  576  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  45.7 
 
 		 972 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  46.07 
 
 		 967 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  45.28 
 
 		 995 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  43.97 
 
 		 942 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  45.98 
 
 		 957 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  45 
 
 		 965 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  43.76 
 
 		 954 aa  571  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  45.53 
 
 		 965 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  44.94 
 
 		 953 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  44.14 
 
 		 1019 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  44.19 
 
 		 946 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11280  excinuclease ABC subunit A  45.89 
 
 		 994 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  44.95 
 
 		 963 aa  568  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  45.51 
 
 		 967 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  44.19 
 
 		 954 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  45.65 
 
 		 960 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2992  excinuclease ABC, A subunit  44.75 
 
 		 1055 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00155304  hitchhiker  0.00399188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  44.59 
 
 		 954 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  43.36 
 
 		 983 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  44.81 
 
 		 946 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  43.63 
 
 		 955 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  43.57 
 
 		 941 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2016  excinuclease ABC subunit A  45.73 
 
 		 923 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  44.51 
 
 		 954 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  44.44 
 
 		 975 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  44.71 
 
 		 973 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  43.16 
 
 		 987 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  43.97 
 
 		 971 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  44.04 
 
 		 976 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 947 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0427  excinuclease ABC subunit A  44.05 
 
 		 1011 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  44.76 
 
 		 982 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  43.16 
 
 		 987 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  42.31 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  42.31 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 		 958 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 		 958 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  42.31 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15150  Excinuclease ABC subunit A  44.44 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  45.13 
 
 		 971 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  42.31 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 975 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  42.17 
 
 		 958 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  42.64 
 
 		 921 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  44.67 
 
 		 947 aa  554  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  40.67 
 
 		 939 aa  553  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  43.45 
 
 		 931 aa  555  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  42.19 
 
 		 959 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  43.67 
 
 		 935 aa  551  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>