24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0667 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 1252 aa  2590    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1235 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1236 aa  899    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1124 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  31.84 
 
 		 1007 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1258 aa  410  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1332 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1022 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1289 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1413 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1246 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1358 aa  210  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1286 aa  131  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1119 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  21.74 
 
 		 692 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  25.73 
 
 		 760 aa  55.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  19.4 
 
 		 1101 aa  51.6  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1080 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  22.84 
 
 		 644 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  23.68 
 
 		 656 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  23 
 
 		 653 aa  46.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  21.47 
 
 		 647 aa  45.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  22.4 
 
 		 785 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  21.81 
 
 		 650 aa  45.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>