More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0190 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  61.83 
 
 		 263 aa  350  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  70.56 
 
 		 269 aa  348  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  66 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  67.2 
 
 		 271 aa  334  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  48.98 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  49.16 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  37.1 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  36.71 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  39.49 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  35.08 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.8 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  35.87 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  37.05 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  34.45 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.42 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  36.05 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  39.8 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  39.8 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  32.31 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  33.48 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  31.54 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  32.86 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  37.05 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.86 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  33.96 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  37.44 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  37.44 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  31.65 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.14 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  35.16 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  35.16 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  32.86 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  34.45 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  35.14 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  33.18 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  38.65 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  34.29 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  36.84 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  34.78 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  31.8 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.48 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.88 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  34.32 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  36.45 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  33.19 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  36.61 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  29.82 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  33.64 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  31.67 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  29.82 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  33.03 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  30.05 
 
 		 377 aa  128  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  34.01 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  31.76 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  33.64 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  30.7 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  30.16 
 
 		 380 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  29.78 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  30.87 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  30.43 
 
 		 383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  32.52 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.94 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  36.18 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  31.44 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  34.36 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  29.91 
 
 		 365 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  28.95 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  31.3 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  32.41 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  28.81 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  31.84 
 
 		 261 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3703  hypothetical protein  30.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  32.34 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  32.85 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  34.42 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  34.42 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  34.42 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  34.93 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  29.33 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  31.14 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.34 
 
 		 376 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  30.33 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>