270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0152 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0152  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
335 aa  690    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.151693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_189  glycosyltransferase domain protein  88.36 
 
 
335 aa  620  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0117061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0201  glycosyl hydrolase domain-containing protein  86.23 
 
 
392 aa  599  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179492  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2798  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
373 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2336  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000420527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
426 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
325 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.09 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  24.13 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.93 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
436 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2193  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
390 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0310577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  29.06 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
623 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
394 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
394 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
394 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  28.23 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
378 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
391 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
426 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
426 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
381 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  27.59 
 
 
394 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
360 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
394 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  21.83 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
377 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
377 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
394 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  23.33 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  23.33 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
427 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  27.84 
 
 
501 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.88 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  24.44 
 
 
415 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  25.24 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  24.87 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
411 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0308  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
364 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  25.52 
 
 
381 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  25 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  37.84 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  24.9 
 
 
385 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
401 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
409 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
376 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  26.4 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  25.81 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  21.91 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>