More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1609 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 210 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  55.12 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.52 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.83 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.72 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  53.92 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  47.62 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  51.67 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  50.51 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  50.7 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.03 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  46.34 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  47.4 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  48.48 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  47.06 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  43.85 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  42.05 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  42.05 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  42.05 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  42.05 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  42.78 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  41.38 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  41.05 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  40.53 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  40.91 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  40.53 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  34.74 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.4 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  42.94 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  42.94 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  42.94 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  42.94 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  49.09 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.5 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.71 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.66 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.62 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  40.21 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.54 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.78 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.97 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  41.05 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.14 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.65 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.14 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.14 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  41.63 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  36.22 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.89 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  35.42 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0093  lysine exporter protein LysE/YggA  47.27 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.60262  decreased coverage  0.0000734751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  37.89 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.12 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.62 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  40.36 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  40.36 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.36 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  40.36 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  37.5 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  34.24 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>