More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1142 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 161 aa  327  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  45.99 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  48 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  45.24 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  42.68 
 
 		 225 aa  84  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  40.18 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.69 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  32.85 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  32.85 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  46 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  33.77 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  39.55 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 		 540 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  40.8 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  33.08 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  44.04 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  45.92 
 
 		 505 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  38.93 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  31.36 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  39.42 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.59 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  32.92 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  38.6 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  43.56 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  36.67 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  38.32 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  43.88 
 
 		 505 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  38.26 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  41.58 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  29.81 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  35.81 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.09 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  33.1 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  35.1 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  41.51 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  41.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  35.29 
 
 		 497 aa  60.8  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.55 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  35.2 
 
 		 503 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  41.8 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  27.03 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  31.72 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  43.88 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  35.2 
 
 		 505 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  30.26 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  41.35 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  35.83 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  29.27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.14 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  38.74 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.68 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  34.59 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  41.58 
 
 		 509 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.2 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  32.72 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.59 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  31.13 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  35.34 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  37.72 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  33.6 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.82 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.81 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  37.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  33.95 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  30.41 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  35.29 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  32.86 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.59 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  42.86 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  36.56 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>