More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2688 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  77.44 
 
 
268 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  75.37 
 
 
282 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  64.66 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
271 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
266 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
265 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
260 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
277 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
264 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  42.96 
 
 
290 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  45.24 
 
 
281 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 
268 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  46.44 
 
 
268 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
269 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
490 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
497 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
271 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
436 aa  201  9e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.39 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
268 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
270 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
266 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
264 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
269 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
268 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.81 
 
 
269 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 
264 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  39.05 
 
 
279 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 
260 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
267 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 
303 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
267 aa  192  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 
272 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 
269 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
272 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
257 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 
284 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
264 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
297 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
269 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
273 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  48.37 
 
 
271 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
267 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
275 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
265 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  44.98 
 
 
271 aa  186  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  37.32 
 
 
276 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  37.32 
 
 
276 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
268 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
268 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 
492 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
265 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.81 
 
 
273 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
268 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
301 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
288 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
288 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.51 
 
 
270 aa  185  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 
283 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
280 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
479 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  45.29 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
269 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
269 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
273 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  44.78 
 
 
518 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
270 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
270 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  43.48 
 
 
531 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
270 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
270 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
270 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>