More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2373 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  100 
 
 		 351 aa  720    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  84.87 
 
 		 357 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  81.95 
 
 		 357 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  76.7 
 
 		 355 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  75.71 
 
 		 359 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3180  recombinase A  80.71 
 
 		 353 aa  547  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.97 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  64.39 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.5 
 
 		 336 aa  454  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  63.64 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  62.99 
 
 		 378 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  61.9 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.69 
 
 		 347 aa  447  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.69 
 
 		 365 aa  447  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.92 
 
 		 350 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  62.5 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.36 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  61.49 
 
 		 347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  63.8 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.5 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63.44 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  64.72 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  59.89 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  64.4 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.11 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.06 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  64.11 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  62.73 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.61 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.61 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.25 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64.11 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63.19 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  61.79 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  64.42 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  62.15 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.3 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  64.42 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.25 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.11 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.08 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  61.83 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  62.27 
 
 		 356 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.77 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  61.19 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  62.39 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  63.64 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  58.89 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.95 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  62.58 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  63.53 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  62.28 
 
 		 351 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  63.08 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.64 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.96 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  63.75 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  62.24 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  65.43 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  65.43 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  62.16 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  63.75 
 
 		 357 aa  437  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  62.16 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  62.16 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.15 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  66.07 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.16 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  60.6 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  60.24 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  60.53 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.31 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  60.12 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  62.54 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.96 
 
 		 361 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  60.92 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  61.54 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  62.38 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.54 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  63.32 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  63.03 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  64.11 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.08 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  62.88 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64.42 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  64.11 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  63.08 
 
 		 359 aa  434  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  63.03 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  63.08 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  64.29 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  61.23 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  61.14 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  61.66 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  62.73 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  62.73 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  62.73 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  61.14 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  59.76 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  63.04 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  64.74 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  61.14 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>