More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3180 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3180  recombinase A  100 
 
 		 353 aa  712    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  80.71 
 
 		 351 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  80.42 
 
 		 355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  79.53 
 
 		 357 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  76.42 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  74.65 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  65.38 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.56 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.97 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.24 
 
 		 378 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  65.85 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  65.74 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.6 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  62.94 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  64.65 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  64.85 
 
 		 359 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  66.36 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  64.05 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  64.51 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  63.99 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  64.65 
 
 		 345 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.79 
 
 		 345 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.28 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  65.54 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64.92 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  65.03 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  65.76 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.14 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.03 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  64.92 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  64.31 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  65.54 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  63.42 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.65 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  61.47 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  62.2 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  62.39 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  63.61 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  62.06 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  63.8 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.36 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.09 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  66.15 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  61.8 
 
 		 347 aa  437  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  59.77 
 
 		 367 aa  434  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  61.34 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  64.11 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  61.34 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  62.87 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.76 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  63.5 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.38 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  61.98 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  64.11 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.31 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.54 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  62.27 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  62.96 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  63.71 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  63.31 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  61.45 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  65.14 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  64.81 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  63.11 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.69 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.98 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  66.56 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  62.54 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  61.18 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  62.24 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64.26 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  66.56 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  64.42 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.3 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  63.41 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.69 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  59.15 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.96 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  62.24 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.69 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  62.27 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  63.71 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  62.5 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  63.09 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.32 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  65.53 
 
 		 348 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.64 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  61.28 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  63.64 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  62.5 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  62.39 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  61.56 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  64.53 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  62.42 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  59.21 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  62.12 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  59.4 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.53 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  60.29 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>