More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1457 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  100 
 
 
400 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  43.7 
 
 
386 aa  335  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  43.78 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  41.93 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
380 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 
390 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  41.24 
 
 
402 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  41.51 
 
 
380 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 
392 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  39.28 
 
 
392 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  39.09 
 
 
392 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  39.03 
 
 
392 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 
379 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  39.07 
 
 
397 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  41.93 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  40.31 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  41.07 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  41.19 
 
 
388 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  38.23 
 
 
405 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 
398 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  42.19 
 
 
376 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  39.07 
 
 
400 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.71 
 
 
395 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  38.76 
 
 
388 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  39.39 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  39.58 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  40 
 
 
377 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  40 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  37.11 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  39.27 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  38.78 
 
 
386 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  37.79 
 
 
392 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
395 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  36.25 
 
 
393 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 
396 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  35.57 
 
 
387 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 
394 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
395 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  36.9 
 
 
394 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  37.22 
 
 
401 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 
397 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  41.76 
 
 
404 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
396 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  37.47 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  36.69 
 
 
395 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  35.79 
 
 
399 aa  266  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 
402 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  36.88 
 
 
400 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 
375 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  37.22 
 
 
404 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  38.72 
 
 
402 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  35.35 
 
 
399 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 
396 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  37.56 
 
 
395 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  37.56 
 
 
397 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  37.69 
 
 
396 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  34.94 
 
 
396 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  38.06 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  34.42 
 
 
399 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  38.08 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  36.8 
 
 
398 aa  262  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  38.64 
 
 
391 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 
402 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  37.66 
 
 
400 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.08 
 
 
388 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  38.16 
 
 
390 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  36.15 
 
 
392 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 
413 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  35.97 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  37.88 
 
 
399 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 
394 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  36.32 
 
 
393 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  38.05 
 
 
382 aa  258  9e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  36.15 
 
 
392 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  37.44 
 
 
402 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.76 
 
 
387 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  38.32 
 
 
384 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 
410 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 
407 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  37.12 
 
 
399 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 
378 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  36.98 
 
 
402 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  37.98 
 
 
386 aa  256  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  38.12 
 
 
393 aa  255  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  35.46 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  34.84 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>