66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1454 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 125 aa  262  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.96 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.25 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  40 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.05 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.26 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.73 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.41 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.73 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.77 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6860  anti-ECFsigma factor, ChrR  47.27 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.35 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  31.07 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  38.24 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.28 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.36 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  32 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  32 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.36 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  34.67 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.13 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.49 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.99 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.46 
 
 		 231 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  40.91 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  38.24 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.67 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  36.49 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1618  anti-ECFsigma factor, ChrR  47.92 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  32.61 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.98 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.57 
 
 		 228 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  31.51 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  35.38 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  37.88 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  31 
 
 		 241 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.78 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.67 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  46.67 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  35.21 
 
 		 226 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.18 
 
 		 220 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.14 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.88 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  40 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.88 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.78 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.31 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.36 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  30.1 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0517  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.95 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112614  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.78 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.82 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  38.98 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  33.9 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  29.03 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.55 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  36.92 
 
 		 223 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5329  hypothetical protein  40.74 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.37 
 
 		 236 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  31.08 
 
 		 225 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.73 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>