More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3273 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  100 
 
 		 607 aa  1231    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  34.71 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  32.5 
 
 		 603 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.29 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  31.22 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  29.28 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  30.11 
 
 		 605 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  29.66 
 
 		 603 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  30.72 
 
 		 628 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  27.78 
 
 		 625 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  30.74 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  30.74 
 
 		 596 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  27.2 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.36 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  30.29 
 
 		 596 aa  220  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  30.29 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  30.62 
 
 		 585 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  28.16 
 
 		 600 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  28.84 
 
 		 599 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.11 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  33.74 
 
 		 606 aa  204  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.06 
 
 		 610 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.07 
 
 		 564 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  39.72 
 
 		 583 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.73 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  39.66 
 
 		 599 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  37.94 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  36.88 
 
 		 601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.1 
 
 		 601 aa  191  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.75 
 
 		 600 aa  190  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  39.54 
 
 		 699 aa  189  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  27.59 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.78 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  30.82 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  33.54 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  29.35 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  25.74 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  25.95 
 
 		 586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  25.7 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.78 
 
 		 594 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  25.39 
 
 		 552 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  41.22 
 
 		 586 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  44.14 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.66 
 
 		 582 aa  177  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.81 
 
 		 582 aa  177  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  42.13 
 
 		 589 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.81 
 
 		 582 aa  177  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.81 
 
 		 582 aa  177  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.91 
 
 		 741 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  26.78 
 
 		 610 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.85 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  28.72 
 
 		 568 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.66 
 
 		 739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  35.41 
 
 		 705 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.74 
 
 		 585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  33.33 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  39.04 
 
 		 578 aa  174  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.6 
 
 		 739 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  39.04 
 
 		 578 aa  174  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.93 
 
 		 582 aa  174  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  26.88 
 
 		 581 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  39.7 
 
 		 700 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.67 
 
 		 641 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.22 
 
 		 1019 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  39.01 
 
 		 731 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.87 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.67 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.55 
 
 		 623 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1780  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.48 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0810264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.19 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.4 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.81 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  42.21 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.65 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.57 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  39.3 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.07 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  40.51 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.42 
 
 		 600 aa  171  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>