More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2034 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  100 
 
 
300 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  41.02 
 
 
301 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  45.74 
 
 
144 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
147 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.52 
 
 
451 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  40.31 
 
 
151 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.83 
 
 
480 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
969 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
129 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
147 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  34.16 
 
 
159 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  40.46 
 
 
470 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  39.69 
 
 
470 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  39.69 
 
 
470 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  39.69 
 
 
470 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  40.16 
 
 
470 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
472 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  32.61 
 
 
455 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  39.37 
 
 
472 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  39.37 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.46 
 
 
971 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
131 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
119 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.87 
 
 
456 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
469 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
469 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
469 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
469 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 
473 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
469 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
157 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
122 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
139 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  40.35 
 
 
471 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0656  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
129 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663964  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
157 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  40 
 
 
151 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  38.17 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1348  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
173 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  38.17 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  38.17 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  38.58 
 
 
470 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.82 
 
 
465 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
151 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.45 
 
 
462 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  42.19 
 
 
142 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
413 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
121 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1685  two component Fis family transcriptional regulator  40.71 
 
 
457 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.35 
 
 
446 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
130 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
128 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 
224 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.21 
 
 
457 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
135 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.17 
 
 
480 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0833  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.39 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.96038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.38 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
127 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.34 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1960  response regulator transcription factor  36.92 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  30.2 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1394  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.26 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.205793  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.64 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
538 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  40 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
135 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
444 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2321  nitrogen regulation protein NR(I)  35.88 
 
 
468 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  39.62 
 
 
411 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4230  helix-turn-helix, Fis-type  36.61 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547094  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.18 
 
 
981 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.75 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1657  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.35 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000574549  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0883  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.88 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4553  DNA-binding response regulator  36.61 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.023221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.6 
 
 
461 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2955  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.47 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  36.13 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.39 
 
 
458 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0198  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.49 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
180 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.25 
 
 
477 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
144 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  39.81 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>