More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1852 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  46.31 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  50.35 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  41.89 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  49.57 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.84 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.84 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  39.2 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  32.24 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  33.86 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.22 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  33.55 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  36.89 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  38.18 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  34.84 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  34.84 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  34.84 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.15 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.16 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  34.18 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.84 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  31.79 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  33.11 
 
 		 504 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  35.42 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  30.5 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  32.31 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  34.97 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  33.04 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  37.21 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  37.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  31.3 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  32.74 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  34.96 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.79 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  31.79 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  39.18 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  31.79 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  31.79 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  31.9 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  32.67 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  33.12 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  34.65 
 
 		 503 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  32.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  32.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.81 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  32.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  34.19 
 
 		 523 aa  63.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  36.09 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  33.08 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.13 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  37.3 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  36.28 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  32.91 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  32.91 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  33.12 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  36 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  31.79 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  32.31 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  31.13 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  30.41 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  34.53 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.79 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  33.09 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  35.63 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  34.15 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  33.97 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  31.79 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  32.47 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  34.23 
 
 		 506 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  34.23 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  31.17 
 
 		 505 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  28.28 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  30.19 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  31.47 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  32.28 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  33.1 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  36.94 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  36.64 
 
 		 505 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  35.48 
 
 		 505 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  33.79 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.16 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>