More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0700 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  40.68 
 
 
176 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  32.58 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.44 
 
 
156 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  39.34 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  42.42 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  34.15 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  36.84 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  35.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  31.75 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  31.75 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  35.88 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  47.13 
 
 
509 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  36.13 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  38.02 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  34.58 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.12 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  47.13 
 
 
513 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  47.13 
 
 
513 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.11 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.11 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  42.68 
 
 
562 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.11 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  34.96 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  34.96 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  34.96 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  34.96 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  34.96 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  35.2 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  37.86 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  43.82 
 
 
503 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  36.84 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  35.77 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  41.3 
 
 
505 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  34.4 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  35.64 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  32.84 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  34.15 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  34.15 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  34.15 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.51 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.42 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  32.14 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  44.71 
 
 
523 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  31.82 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.24 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  46.34 
 
 
497 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  35.38 
 
 
540 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  38.32 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  45.78 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 
542 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  34.09 
 
 
549 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  32.81 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  34.43 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  45.12 
 
 
506 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  37.27 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  34.92 
 
 
504 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  33.9 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  33.57 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  45.12 
 
 
505 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  39.8 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  35.77 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.14 
 
 
472 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  34.68 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  38.38 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.78 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  42.45 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  43.9 
 
 
509 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  33.87 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  34.33 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  42.05 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  43.9 
 
 
505 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  36.5 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  29.1 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>