More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0696 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 257 aa  533  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  64.06 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  64.2 
 
 		 259 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  64.2 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  59.45 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  54.85 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  54.26 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  51.36 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  49.8 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  51.75 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  50.59 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  50.2 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  51.76 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  48.25 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  49.01 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  48.41 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  48.41 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  48.22 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 258 aa  254  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  48.81 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  49.4 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  47.27 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  47.43 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  49.01 
 
 		 250 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  48.03 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  46.85 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  48.22 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  44.49 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  48.62 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  48.62 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  48.62 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  47.47 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  48.22 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  48.22 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  47.58 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  46.25 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  44.75 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  44.75 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  44.75 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.26 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  49.02 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  46.04 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  45.28 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  48.22 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  47.45 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  47.24 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  44.14 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  44.09 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  46.33 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  43.4 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  46.3 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.33 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  42.35 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  42.35 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.58 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  43.41 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  40.86 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  38.28 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  38.65 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.93 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  39.77 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  40.62 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  40.71 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  39.22 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  39.22 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.32 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.45 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  39.04 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  39.22 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  38.22 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  42 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  38.67 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.67 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  39.22 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  37.94 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  39.22 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  36.12 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  40.39 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  38.82 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  38.74 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  39.06 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  37.94 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  35.34 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>