36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0381 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  100 
 
 		 142 aa  276  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  35.38 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  43.21 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  43.65 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  38.58 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  41.35 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  36.43 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  37.1 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  38.05 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  37.19 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  36.84 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.68 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  34.51 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  33.33 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  33.08 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.6 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  35.11 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  31.25 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.25 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  29.2 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  33.09 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  33.65 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  39.25 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  33.61 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  31.97 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  34.19 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  29.92 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  30.33 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  34.07 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  30.33 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  35.54 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1826  hypothetical protein  30.66 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000267645  decreased coverage  0.0000000000616753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  40.59 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  32.28 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  30.88 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0919  hypothetical protein  29.63 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0994011  hitchhiker  0.0000000890175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>