More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3383 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
356 aa  731    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  69.3 
 
 
357 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  68.36 
 
 
350 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  66.29 
 
 
356 aa  494  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  69.8 
 
 
351 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  68.63 
 
 
357 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  68.95 
 
 
351 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  67.52 
 
 
348 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  67.81 
 
 
348 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  68.38 
 
 
348 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  67.52 
 
 
348 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  67.7 
 
 
355 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  66.76 
 
 
354 aa  485  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
350 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
355 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
355 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  65.54 
 
 
350 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  65.54 
 
 
355 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  66.95 
 
 
351 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  65.82 
 
 
350 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  66.95 
 
 
359 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
357 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  65.82 
 
 
371 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  64.9 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  64.69 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  67.23 
 
 
355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  64.97 
 
 
355 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  65.73 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  64.69 
 
 
356 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  65.45 
 
 
355 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  64.41 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  64.12 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  65.25 
 
 
359 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  64.41 
 
 
357 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  64.12 
 
 
357 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  64.12 
 
 
357 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  64.12 
 
 
357 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  61.34 
 
 
355 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  60.45 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  62.99 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  60.17 
 
 
353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  58.13 
 
 
369 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  63.9 
 
 
356 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 
352 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60.45 
 
 
351 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  56.46 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  58.77 
 
 
370 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  58.15 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  56.21 
 
 
355 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  52.54 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 
367 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
355 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 
377 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  53.39 
 
 
351 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  52.21 
 
 
377 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  48.14 
 
 
356 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
355 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 
354 aa  348  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  46.31 
 
 
349 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  44.07 
 
 
356 aa  294  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  41.79 
 
 
350 aa  288  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 
350 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  42.24 
 
 
350 aa  262  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  38.86 
 
 
350 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  38.22 
 
 
350 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
347 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
348 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  40.52 
 
 
347 aa  245  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
348 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
350 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
350 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
350 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  41.88 
 
 
358 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  38.71 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
364 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
358 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  35.16 
 
 
365 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 
355 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
360 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 
369 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 
362 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
370 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.08 
 
 
392 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
367 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
335 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
362 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.02 
 
 
371 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
386 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
380 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.61 
 
 
358 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 
358 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
386 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.17 
 
 
365 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
374 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>