More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2352 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2352  thiolase  100 
 
 
395 aa  800    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422281  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0409  acetyl-CoA acetyltransferase  72.19 
 
 
399 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.67 
 
 
385 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
379 aa  391  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 
380 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
382 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
383 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  47.74 
 
 
391 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 
385 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6477  acetyl-CoA acetyltransferase  47.15 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  45.68 
 
 
394 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.15 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
390 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
385 aa  311  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4310  acetyl-CoA acetyltransferases  45.76 
 
 
385 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2116  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 
385 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4557  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4080  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.5 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4156  acetyl-CoA acetyltransferases  45.5 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
393 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
381 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2056  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.67 
 
 
383 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0105  acetyl-CoA acetyltransferases  44.64 
 
 
392 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.242264 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.61 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.64 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0122  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  46.15 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3782  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4589  acetyl-CoA acetyltransferases  44.76 
 
 
385 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2356  acetyl-CoA acetyltransferases  45.91 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868469  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0597  thiolase  45.11 
 
 
394 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149979  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  45.76 
 
 
380 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2317  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.66 
 
 
394 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.682809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2364  acetyl-CoA acetyltransferases  45.66 
 
 
394 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0342235  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0031  acetyl-CoA acetyltransferase  42.97 
 
 
386 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0253  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
380 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.74216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 
397 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4479  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
390 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0275015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  45.24 
 
 
381 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4992  acetyl-CoA acetyltransferase  45.59 
 
 
390 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000489086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7123  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
390 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.9 
 
 
379 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647319  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5156  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.68 
 
 
392 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1669  thiolase  45.07 
 
 
392 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5371  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 
389 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1278  thiolase  43.07 
 
 
397 aa  292  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
383 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.960065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  43.72 
 
 
390 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.22 
 
 
387 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3611  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
391 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 
391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4206  acetyl-CoA acetyltransferases  43.37 
 
 
381 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  43.69 
 
 
384 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.4 
 
 
385 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5075  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4690  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4776  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  41.96 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3657  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.838334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.72 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.72 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.72 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  41.92 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2629  acetyl-CoA acetyltransferase  41.92 
 
 
393 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13589  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
386 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0901643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0912  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
385 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3753  acetyl-CoA acetyltransferases  42.75 
 
 
383 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3630  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
382 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.78 
 
 
387 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1903  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 
391 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  41.01 
 
 
390 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5282  acetyl-CoA acetyltransferase  43.62 
 
 
382 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2445  acetyl-CoA acetyltransferase  43.94 
 
 
390 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3741  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.49 
 
 
383 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3814  acetyl-CoA acetyltransferases  42.49 
 
 
383 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
402 aa  279  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  43.99 
 
 
383 aa  279  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.53 
 
 
387 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1439  acetyl-CoA acetyltransferase  43.62 
 
 
383 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674587  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2194  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
390 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1000  acetyl-CoA acetyltransferase  44.74 
 
 
392 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5432  acetyl-CoA acetyltransferase  43 
 
 
392 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3993  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.88 
 
 
386 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.28 
 
 
387 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.28 
 
 
387 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4817  acetyl-CoA acetyltransferase  41.6 
 
 
394 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2764  acetyl-CoA acetyltransferases  42.71 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.870348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.28 
 
 
387 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.28 
 
 
387 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2807  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 
377 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.138053  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0445  acetyl-CoA acetyltransferase  42.78 
 
 
392 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7193  acetyl-CoA acetyltransferase  43.01 
 
 
373 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19540  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
382 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.96 
 
 
387 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>