27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1916 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1916  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2305  nucleic acid-binding protein  56.29 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.529702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3058  nucleotide-binding protein  60 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000916186  decreased coverage  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0715  nucleotide-binding protein  51.52 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.896502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2553  hypothetical protein  55.56 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000243914  unclonable  0.00000000000814228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4952  nucleotide-binding protein  52.45 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3810  hypothetical protein  33.69 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4421  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  50.32 
 
 		 596 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0118398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4098  hypothetical protein  33.69 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3111  nucleotide-binding protein  40.2 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.539326  normal  0.0149562 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6984  Nucleotide-binding protein, predicted, TIR-like protein  47.97 
 
 		 151 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0138  hypothetical protein  48.97 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2763  hypothetical protein  48.1 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3313  hypothetical protein  40 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0620  nucleotide-binding protein containing TIR -like protein domain-like protein  37.91 
 
 		 507 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1741  nucleotide-binding protein  39.75 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6597  nucleotide-binding protein  46.55 
 
 		 127 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2614  hypothetical protein  41.61 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1614  hypothetical protein  42.19 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0816  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2712  hypothetical protein  32.59 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3059  hypothetical protein  47.54 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.828132  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1435  hypothetical protein  25.47 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0038  hypothetical protein  33.66 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0444  tetratricopeptide domain-containing protein  33.71 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.317749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3082  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  31.08 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>