50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1071 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1071  CheW protein  100 
 
 		 891 aa  1844    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  40.02 
 
 		 875 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1709  hypothetical protein  41.23 
 
 		 668 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0470  CheW protein  32.67 
 
 		 848 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2970  CheW protein  32.8 
 
 		 841 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2145  hypothetical protein  35.12 
 
 		 692 aa  361  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3594  CheW protein  29.59 
 
 		 946 aa  289  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170517  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 341 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1377  methyl-accepting chemotaxis protein  32.07 
 
 		 370 aa  83.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139679  normal  0.610806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0080  chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0081  chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.71 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3892  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.26 
 
 		 352 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 		 361 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 368 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.74 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.38 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0082  chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.73 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1975  chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 		 359 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  23.18 
 
 		 170 aa  51.6  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  25.95 
 
 		 163 aa  51.6  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.74 
 
 		 189 aa  51.2  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  21.57 
 
 		 170 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  24.16 
 
 		 150 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  24.16 
 
 		 150 aa  50.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  27.27 
 
 		 179 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  26.92 
 
 		 531 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  26.62 
 
 		 165 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  25.66 
 
 		 169 aa  47  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  24.59 
 
 		 179 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  24.59 
 
 		 179 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25.6 
 
 		 159 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2533  CheW protein  27 
 
 		 198 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.83 
 
 		 163 aa  45.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  25.45 
 
 		 779 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  23.08 
 
 		 168 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  24.59 
 
 		 179 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.72 
 
 		 189 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  21.79 
 
 		 201 aa  44.3  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  18.98 
 
 		 200 aa  44.3  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>