More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1080 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 368 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.29 
 
 		 368 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1377  methyl-accepting chemotaxis protein  68.93 
 
 		 370 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0080  chemotaxis sensory transducer  45 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0082  chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0081  chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139679  normal  0.610806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3892  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.37 
 
 		 352 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 366 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1975  chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.86 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  30.77 
 
 		 875 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0470  CheW protein  30.57 
 
 		 848 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2145  hypothetical protein  27.57 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2970  CheW protein  26.5 
 
 		 841 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1709  hypothetical protein  26.09 
 
 		 668 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1071  CheW protein  25.73 
 
 		 891 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 664 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 664 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.271483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  41.59 
 
 		 623 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0584  methyl-accepting chemotaxis protein  40.83 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.57 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.64 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  48.65 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 662 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 659 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 651 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 653 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  36.79 
 
 		 678 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 659 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 665 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 664 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5250  hypothetical protein  42.28 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869882  normal  0.134387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0500  methyl-accepting chemotaxis protein  38.05 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3579  chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 554 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 		 484 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  36.79 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1028  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  42.86 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  53.85 
 
 		 543 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  36.79 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  36.79 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 		 524 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  36.79 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.71 
 
 		 524 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4286  hypothetical protein  43.69 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  42.86 
 
 		 663 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  43.4 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6278  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  43.4 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.41 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  44.74 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 655 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 655 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 		 655 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.14 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  39.82 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6056  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6681  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  43.4 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  45.05 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 603 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.64 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  50.6 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000913296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.83 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>