29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2145 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1436    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1709  hypothetical protein  41.68 
 
 		 668 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  34.68 
 
 		 875 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1071  CheW protein  35.12 
 
 		 891 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2970  CheW protein  34.55 
 
 		 841 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0470  CheW protein  34.11 
 
 		 848 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3594  CheW protein  26.06 
 
 		 946 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170517  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.21 
 
 		 368 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.86 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1377  methyl-accepting chemotaxis protein  26.04 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0080  chemotaxis sensory transducer  23.35 
 
 		 362 aa  73.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0082  chemotaxis sensory transducer  24.77 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.85 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.38 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139679  normal  0.610806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.81 
 
 		 362 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0081  chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.24 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.6 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3892  putative methyl-accepting chemotaxis protein  24.03 
 
 		 352 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.12 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1975  chemotaxis sensory transducer  26.25 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.24 
 
 		 409 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>