26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3594 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3594  CheW protein  100 
 
 		 946 aa  1883    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170517  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2970  CheW protein  38.01 
 
 		 841 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0470  CheW protein  35.94 
 
 		 848 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1071  CheW protein  29.6 
 
 		 891 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  28 
 
 		 875 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1709  hypothetical protein  30.4 
 
 		 668 aa  254  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2145  hypothetical protein  26.47 
 
 		 692 aa  233  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 		 364 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1975  chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 		 364 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0082  chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 		 359 aa  54.3  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1377  methyl-accepting chemotaxis protein  27.89 
 
 		 370 aa  54.7  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.44 
 
 		 362 aa  54.3  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0080  chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 		 362 aa  53.5  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 368 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0081  chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 362 aa  51.2  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 368 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 		 359 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 		 371 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 345 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139679  normal  0.610806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.58 
 
 		 367 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3892  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.7 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 361 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 		 352 aa  44.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>