31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1709 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1361    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2145  hypothetical protein  41.68 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  40.65 
 
 		 875 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1071  CheW protein  41.23 
 
 		 891 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2970  CheW protein  40.83 
 
 		 841 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0470  CheW protein  37.98 
 
 		 848 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3594  CheW protein  30.01 
 
 		 946 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170517  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 362 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.48 
 
 		 362 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0082  chemotaxis sensory transducer  27.61 
 
 		 359 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.3 
 
 		 359 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.906877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0080  chemotaxis sensory transducer  26.91 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0081  chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  0.828358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.47 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1377  methyl-accepting chemotaxis protein  26.15 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.37 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139679  normal  0.610806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4260  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3892  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.81 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1975  chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 364 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 		 366 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.28 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 642 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 591 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>