52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0855 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  55.36 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  52.67 
 
 		 365 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  52.24 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  55.2 
 
 		 292 aa  271  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  32.49 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.52 
 
 		 680 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  27.78 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  28.73 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  27.5 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.3 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  27.27 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.11 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  26.54 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  28.68 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 295 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>