More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0498 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  100 
 
 		 563 aa  1142    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  48.13 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  44.85 
 
 		 614 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  43.96 
 
 		 564 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  44.27 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  44.01 
 
 		 575 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  41.21 
 
 		 564 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  41.18 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  41.71 
 
 		 546 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  40.43 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  33.39 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  31.61 
 
 		 650 aa  300  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.45 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.46 
 
 		 350 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.62 
 
 		 350 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.71 
 
 		 337 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.17 
 
 		 355 aa  93.6  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.91 
 
 		 351 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 		 346 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 347 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.49 
 
 		 332 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.06 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  21.43 
 
 		 346 aa  87.4  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25 
 
 		 334 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25 
 
 		 334 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.43 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 330 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.33 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.33 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  23.57 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  29.57 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.86 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.63 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  24.71 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  21.37 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  27.7 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.45 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.46 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  22.93 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  31.72 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.29 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  26.22 
 
 		 341 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  24.09 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  22.66 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.54 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  22.56 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.88 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.41 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.36 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.03 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.36 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25.36 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  21.28 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.45 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  27.61 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.61 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.25 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 		 359 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.59 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.69 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  23.51 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  21.4 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  24.27 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.67 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  35.92 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  35.43 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.99 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  31.2 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  24.35 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  31.62 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.22 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  30.83 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  19.4 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  30.83 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.73 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  24.83 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  28.67 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  30.07 
 
 		 232 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  28.08 
 
 		 652 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.46 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>