67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5859 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  50.57 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  50.28 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  48.63 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  45.99 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  47.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  45.71 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  47.4 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  46.59 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  45.93 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  45.71 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  40.59 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  34.9 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  33.14 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.8 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 195 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>