50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0921 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  833    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  92.89 
 
 
408 aa  769    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  91.42 
 
 
408 aa  758    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  68.69 
 
 
407 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  57.79 
 
 
412 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  57.83 
 
 
399 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  58.82 
 
 
406 aa  471  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  56.27 
 
 
423 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  58.59 
 
 
405 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  56.46 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  56.51 
 
 
390 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  54.69 
 
 
390 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  51.82 
 
 
390 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  52.34 
 
 
421 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  50.93 
 
 
388 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  48.88 
 
 
502 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  48.44 
 
 
500 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  47.5 
 
 
500 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  47.1 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  48.3 
 
 
455 aa  355  5.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  48.43 
 
 
503 aa  354  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  49.22 
 
 
434 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  45.85 
 
 
389 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  45.64 
 
 
438 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  45.45 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  45.5 
 
 
502 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  45.23 
 
 
502 aa  340  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  43.88 
 
 
404 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  43.62 
 
 
404 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  43.36 
 
 
389 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  44.92 
 
 
511 aa  333  3e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  45.18 
 
 
513 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  45.18 
 
 
513 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  43.18 
 
 
384 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  43.7 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  44.92 
 
 
513 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  41.56 
 
 
503 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  43.91 
 
 
513 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.89 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  30.25 
 
 
413 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  28.25 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  28.13 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  28.32 
 
 
405 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28.03 
 
 
408 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  24.35 
 
 
427 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  23.76 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  26.48 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  26.2 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  25.49 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  23.83 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>