More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4173 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  100 
 
 
168 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  72.62 
 
 
172 aa  266  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  71.43 
 
 
167 aa  265  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  74.53 
 
 
175 aa  262  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3755  NADH dehydrogenase subunit J  70.3 
 
 
175 aa  260  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.596024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  70.66 
 
 
174 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  70.06 
 
 
174 aa  255  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1242  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  71.17 
 
 
175 aa  251  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03251  NADH dehydrogenase subunit J  57.89 
 
 
176 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25241  NADH dehydrogenase subunit J  53.51 
 
 
185 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03151  NADH dehydrogenase subunit J  56.47 
 
 
176 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0737318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  53.71 
 
 
188 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0294  NADH dehydrogenase subunit J  55.56 
 
 
176 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03181  NADH dehydrogenase subunit J  54.39 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.219066  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03161  NADH dehydrogenase subunit J  55.36 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0232  NADH dehydrogenase subunit J  53.22 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  52.02 
 
 
173 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  52.02 
 
 
173 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.15 
 
 
175 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.69 
 
 
175 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  43.7 
 
 
250 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.24 
 
 
172 aa  101  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  71.43 
 
 
485 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  43.09 
 
 
226 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.98 
 
 
172 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.89 
 
 
248 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  44.25 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.52 
 
 
148 aa  97.4  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.14 
 
 
166 aa  97.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.5 
 
 
245 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
412 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
421 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
231 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
409 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  41.8 
 
 
245 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  41.46 
 
 
240 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
231 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
231 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
449 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.35 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  48.24 
 
 
235 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
317 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
317 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  68.25 
 
 
387 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  55.7 
 
 
213 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
421 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.64 
 
 
180 aa  94.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
481 aa  94  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.31 
 
 
587 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  42.15 
 
 
253 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  49.41 
 
 
229 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  40.16 
 
 
245 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.27 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.54 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  40.65 
 
 
225 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.46 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1697  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.24 
 
 
595 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.395952  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  46.53 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.67 
 
 
309 aa  92.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  43.69 
 
 
214 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  44.53 
 
 
236 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.41 
 
 
246 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.83 
 
 
196 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  38.52 
 
 
225 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  41.67 
 
 
593 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.67 
 
 
593 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.41 
 
 
190 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.01 
 
 
787 aa  91.3  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  49.41 
 
 
236 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3749  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  43.14 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000373456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3410  NADH dehydrogenase subunit C  44 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.060616  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.62 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  42.19 
 
 
229 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
252 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  60.32 
 
 
291 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.43 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0575  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  50 
 
 
591 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  37.69 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.62 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.52 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.43 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0586  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  50 
 
 
591 aa  89  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
230 aa  89  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2568  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.5 
 
 
593 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.23 
 
 
169 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.5 
 
 
593 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1207  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.6 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  normal  0.447027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.83 
 
 
593 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  47.06 
 
 
252 aa  87.8  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.67 
 
 
594 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.24 
 
 
227 aa  87.8  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.53 
 
 
283 aa  87.8  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.19 
 
 
593 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.83 
 
 
593 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4121  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.83 
 
 
593 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1744  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.83 
 
 
593 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734404  normal  0.199576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.73 
 
 
794 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.67 
 
 
171 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 
794 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28460  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.5 
 
 
593 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>