More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0851 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  72.49 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  71.18 
 
 		 256 aa  340  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.78 
 
 		 257 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.78 
 
 		 257 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.22 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  61.3 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  64.16 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.87 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.44 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.63 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 240 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.36 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.36 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  38.63 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  38.63 
 
 		 244 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.19 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  39.63 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.91 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 		 225 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.91 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 231 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  39.56 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  37.22 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  39.91 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  40 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  35.96 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.44 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.07 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.45 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  36.6 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.21 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.46 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>