More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2029 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2029  ABC transporter related protein  100 
 
 
501 aa  984    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3888  ABC transporter related protein  53.83 
 
 
509 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.011244  normal  0.230872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.78 
 
 
503 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.42 
 
 
497 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 
498 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
505 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.9 
 
 
519 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.26 
 
 
496 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  44.31 
 
 
516 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  43.7 
 
 
511 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.28 
 
 
495 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.97 
 
 
504 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  43.27 
 
 
522 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.94 
 
 
519 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  42.54 
 
 
505 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
506 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.39 
 
 
499 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.93 
 
 
508 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 
505 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.11 
 
 
501 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.19 
 
 
524 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.19 
 
 
524 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  39.67 
 
 
495 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.55 
 
 
494 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.67 
 
 
524 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.03 
 
 
509 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.88 
 
 
495 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.5 
 
 
501 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  38.88 
 
 
500 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.22 
 
 
500 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.82 
 
 
497 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.42 
 
 
516 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  41.68 
 
 
515 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.53 
 
 
506 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.78 
 
 
524 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.42 
 
 
516 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.42 
 
 
516 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.42 
 
 
516 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  40.64 
 
 
511 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.42 
 
 
501 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.75 
 
 
518 aa  359  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.11 
 
 
501 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 
501 aa  359  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
527 aa  359  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
516 aa  359  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
508 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.3 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  42.16 
 
 
495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.22 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.22 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  43.4 
 
 
507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.48 
 
 
517 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.61 
 
 
502 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.87 
 
 
513 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
501 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.2 
 
 
506 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.85 
 
 
495 aa  355  7.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.36 
 
 
521 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  39.96 
 
 
501 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.38 
 
 
524 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.67 
 
 
516 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  42.89 
 
 
518 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 
500 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.53 
 
 
524 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
510 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  43.16 
 
 
492 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
499 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.15 
 
 
512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  40.53 
 
 
516 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  39.96 
 
 
496 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  41.87 
 
 
513 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 
507 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.72 
 
 
507 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 
497 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  41.99 
 
 
505 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43 
 
 
507 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  42.95 
 
 
492 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.51 
 
 
497 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.92 
 
 
519 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.63 
 
 
510 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.41 
 
 
513 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
507 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 
508 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
501 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  42.71 
 
 
512 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.58 
 
 
494 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.8 
 
 
507 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 
525 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  39.88 
 
 
512 aa  349  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  42.6 
 
 
526 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  40.97 
 
 
501 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
507 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.52 
 
 
494 aa  349  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>