More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1008 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
472 aa  890    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  27.45 
 
 
487 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 
487 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  28.34 
 
 
487 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  27.7 
 
 
559 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  27.63 
 
 
559 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  27.7 
 
 
487 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  27.63 
 
 
487 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  28.23 
 
 
559 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  27.15 
 
 
487 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  27.62 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  39.47 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 
468 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  26.69 
 
 
453 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
468 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 
502 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 
458 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  23.93 
 
 
458 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
507 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4653  hypothetical protein  37.81 
 
 
371 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.465095  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
509 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  35.31 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
430 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
523 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
541 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.88 
 
 
483 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
485 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4583  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
518 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.933507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.23 
 
 
510 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  29.47 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
506 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 
487 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
519 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
516 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
495 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4116  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
499 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
521 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
524 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.83 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 
517 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 
539 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
560 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
525 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
511 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.14 
 
 
509 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.22 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  29.19 
 
 
506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
546 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 
520 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  32.75 
 
 
530 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
534 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.31 
 
 
503 aa  126  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4726  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
519 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.670318  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 
534 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 
541 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.39 
 
 
510 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  29.48 
 
 
519 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
498 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.82 
 
 
414 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
552 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  29.48 
 
 
519 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
504 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  29.72 
 
 
536 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
503 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
509 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 
528 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.01 
 
 
526 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  29.59 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  29.82 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  31.88 
 
 
504 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  28.84 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.68 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
526 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
433 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.651864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 
517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 
517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  27.8 
 
 
569 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.9 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 
527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 
530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  29.2 
 
 
517 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  27.71 
 
 
487 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
513 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
1043 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>