More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2426 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  35.77 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  33.46 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  30.83 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  34.4 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  34.7 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  32.37 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  30.65 
 
 		 280 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  31.17 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  34.41 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  34.57 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.46 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  33.2 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  34.41 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  32.96 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  30.77 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  31.6 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  32.66 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  33.6 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  31.09 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  32.39 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  33.06 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  29.06 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  33.87 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  29.06 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  30.97 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  27.92 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  28.68 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.97 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  28.52 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  30.98 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  28.87 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  28.87 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  28.87 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  28.87 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  30.59 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  52.1 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  28.52 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  28.52 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  28.52 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  28.98 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  27.48 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  28.52 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  49.58 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  28.95 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  28.62 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  27.57 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  30.74 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  28.98 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  30.51 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  29.88 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  28.34 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  48.36 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  25.4 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.94 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  26.07 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  25.96 
 
 		 325 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  30.04 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  29.08 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  28.24 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  26.21 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  31.02 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  27.46 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  27.76 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  25.56 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  27.96 
 
 		 329 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  29.48 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>