More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2338 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2338  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 410 aa  846    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  49.63 
 
 		 407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0742  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  22.53 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1623  hypothetical protein  25.23 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126931  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  30.95 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1232  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  35.71 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  22.84 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.61 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  28.09 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 623 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  23.96 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1150  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 326 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  32.35 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1180  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.632895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  27.82 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5185  hypothetical protein  27.33 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  30.48 
 
 		 803 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 689 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  20.62 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 1261 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1232 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04420  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.35 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  32.35 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  32.35 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1455  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.862393  hitchhiker  0.0000873502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 344 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 380 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  24.72 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.78 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1234  glycosyl transferase group 1  48 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000428229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.06 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  23.39 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  20.87 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  31.52 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 871 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  25.4 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  21.1 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  19.75 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  30.39 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>