21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5185 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5185  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  614  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04420  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1623  hypothetical protein  36.36 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1180  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.632895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1150  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2338  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 410 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0742  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  34.29 
 
 		 372 aa  45.8  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 850 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  36.11 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 1028 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25.53 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 1089 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 402 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 395 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>